Das Schaffhauser Münster ist der ursprünglichste romanische Kirchenbau der Schweiz. Die einstige Benediktinerabtei Allerheiligen mit der um 1106 geweihten Klosterkirche und dem Münsterturm aus der 2. Hälfte des 12. Jahrhunderts zählt zu den wenigen, gut erhaltenen, romanischen Klosteranlagen der Schweiz. Um 1090 legte man die Grundmauern zu einem grossen, fünfschiffigen Münster. Der Bau blieb aber in den Fundamenten stecken und an seiner Stelle realisierte man das heutige Münster. Der Münsterturm wurde um 1150 errichtet, der Turmhelm ist spätgotisch. 1524 wurde die Benediktinerabtei aufgehoben und das Münster zur Pfarrkirche. Heute ist das Münster Gottesdienstraum der evangelisch-reformierten Kirchgemeinde Schaffhausen-Münster und dient ausserdem als Konzertkirche.
Bei der Bombardierung von Schaffhausen durch US-Bomber am 1. April 1944 wurden Teile des Klosters, darunter die neue Abtei, zerstört, aber später wieder aufgebaut. In den Jahren 1950 bis 1973 wurde das Münster zu Allerheiligen mit Unterstützung des Bundes innen und aussen umfassend renoviert und unter Schutz der Eidgenossenschaft gestellt.