Das Museum zu Allerheiligen, untergebracht im ehemaligen Benediktinerkloster Allerheiligen, ist das grösste Universalmuseum der Schweiz. Es präsentiert neben den Zeugnissen aus der Klostervergangenheit unter einem Dach Archäologie und Kulturgeschichte, eine bedeutende Kunstsammlung mit Werken von Cranach, Hodler, Vallotton, Otto Dix und Adolf Dietrich sowie eine naturkundliche Sammlung. Ein besonderes Highlight ist der berühmte "Schaffhauser Onyx", ein antik/mittelalterliches Schmuckstück von Weltrang. Münster, Kreuzgang und Kräutergarten sind tagsüber frei zugänglich. Das Museumscafe, im Sommer im idyllischen Innenhof, lädt zum Verweilen und Entspannen ein.